Потому что интегрированной графике нужны эти линии PCIe. Если ты хочешь, чтобы эти линии были заняты твоими слотами PCIe, тебе придётся купить процессор без встроенной графики.

Интегрированная графика всегда сложнее пропустить через IOMMU. Она еще и находится в одной группе IOMMU с другими устройствами, что требует небезопасного обходного пути (поэтому я и не советую так делать). Куча тем на эту тему на этом форуме: https://forum.proxmox.com/search/7393236/?q=5700G&t=post&c[child_nodes]=1&c[nodes][0]=16&o=date. Если используешь Ryzen с интегрированной графикой, у тебя будет на 8 PCIe линий меньше для других устройств. Если у тебя материнская плата AM4, которая может делать два слота x16, то только один будет usable при использовании Ryzen с интегрированной графикой. Обычно это указано в спецификациях материнской платы на сайте производителя.

Скорее всего, нет, потому что из-за встроенной графики вы теряете один x16 слот, а третий x16 слот не поддерживает passthrough (потому что это материнская плата B550, а не X570). Но у меня нет аналогичного или похожего оборудования, чтобы знать наверняка.

Это не про проброс. У Ryzen ограниченное количество линий PCIe (которые не то же самое, что слоты, может, это какая-то особенность перевода). Ryzen с интегрированной графикой имеет на 8 линий PCIe меньше. Пожалуйста, посмотрите Википедию и сайт AMD, если мне не верите.