Загрузился в режим восстановления, и выяснилось, что у него проблемы с монтированием внешнего диска, указанного в fstab. Странно, потому что индикатор питания на диске показывал, что он активен, но пришлось переподключать его, чтобы он снова смонтировался. Получается, что проблемы с обновлением и фиксацией не связаны с этим; просто не вовремя вышло.